Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms