Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms