Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc114Q3UX62 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms