Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm28047Q3US59 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm28047Q3US59 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm28047Q3US59 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm28047Q3US59 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm28047Q3US59 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm28047Q3US59 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm28047Q3US59 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm28047Q3US59 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm28047Q3US59 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm28047Q3US59 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm28047Q3US59 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm28047Q3US59 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm28047Q3US59 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm28047Q3US59 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm28047Q3US59 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm28047Q3US59 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm28047Q3US59 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm28047Q3US59 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm28047Q3US59 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm28047Q3US59 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm28047Q3US59 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm28047Q3US59 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm28047Q3US59 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm28047Q3US59 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm28047Q3US59 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm28047Q3US59 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm28047Q3US59 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm28047Q3US59 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm28047Q3US59 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm28047Q3US59 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm28047Q3US59 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms