Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIR3

Dtx3l, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3lQ3UIR3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms