Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms