Protein–RNA interactions for Protein: Q3U410

Klhl21, Kelch-like protein 21, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl21Q3U410 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms