Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms