Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms