Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms