Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp8Q2V6D6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp8Q2V6D6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp8Q2V6D6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp8Q2V6D6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp8Q2V6D6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp8Q2V6D6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp8Q2V6D6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp8Q2V6D6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp8Q2V6D6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp8Q2V6D6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp8Q2V6D6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp8Q2V6D6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp8Q2V6D6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp8Q2V6D6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp8Q2V6D6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp8Q2V6D6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp8Q2V6D6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp8Q2V6D6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp8Q2V6D6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp8Q2V6D6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp8Q2V6D6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp8Q2V6D6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp8Q2V6D6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp8Q2V6D6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp8Q2V6D6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp8Q2V6D6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp8Q2V6D6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp8Q2V6D6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp8Q2V6D6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp8Q2V6D6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp8Q2V6D6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp8Q2V6D6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp8Q2V6D6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms