Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms