Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBE6

Pi4k2a, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4k2aQ2TBE6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pi4k2aQ2TBE6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pi4k2aQ2TBE6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pi4k2aQ2TBE6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pi4k2aQ2TBE6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pi4k2aQ2TBE6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pi4k2aQ2TBE6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pi4k2aQ2TBE6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pi4k2aQ2TBE6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pi4k2aQ2TBE6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pi4k2aQ2TBE6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pi4k2aQ2TBE6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pi4k2aQ2TBE6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pi4k2aQ2TBE6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pi4k2aQ2TBE6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pi4k2aQ2TBE6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pi4k2aQ2TBE6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pi4k2aQ2TBE6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pi4k2aQ2TBE6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pi4k2aQ2TBE6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pi4k2aQ2TBE6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pi4k2aQ2TBE6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pi4k2aQ2TBE6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pi4k2aQ2TBE6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pi4k2aQ2TBE6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pi4k2aQ2TBE6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms