Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms