Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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