Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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