Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Perm1Q149B8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms