Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SctQ08535 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SctQ08535 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SctQ08535 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SctQ08535 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SctQ08535 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SctQ08535 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SctQ08535 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SctQ08535 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SctQ08535 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SctQ08535 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SctQ08535 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SctQ08535 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SctQ08535 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SctQ08535 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SctQ08535 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SctQ08535 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SctQ08535 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SctQ08535 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SctQ08535 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SctQ08535 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SctQ08535 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SctQ08535 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SctQ08535 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SctQ08535 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SctQ08535 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SctQ08535 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SctQ08535 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SctQ08535 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SctQ08535 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SctQ08535 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SctQ08535 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SctQ08535 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SctQ08535 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SctQ08535 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SctQ08535 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SctQ08535 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SctQ08535 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SctQ08535 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SctQ08535 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SctQ08535 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SctQ08535 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SctQ08535 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SctQ08535 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SctQ08535 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SctQ08535 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SctQ08535 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SctQ08535 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SctQ08535 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SctQ08535 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SctQ08535 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SctQ08535 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SctQ08535 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SctQ08535 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SctQ08535 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SctQ08535 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SctQ08535 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SctQ08535 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SctQ08535 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SctQ08535 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SctQ08535 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SctQ08535 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SctQ08535 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SctQ08535 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SctQ08535 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SctQ08535 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SctQ08535 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SctQ08535 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SctQ08535 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SctQ08535 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SctQ08535 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SctQ08535 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SctQ08535 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SctQ08535 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SctQ08535 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SctQ08535 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SctQ08535 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SctQ08535 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SctQ08535 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SctQ08535 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SctQ08535 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SctQ08535 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SctQ08535 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SctQ08535 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SctQ08535 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SctQ08535 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SctQ08535 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SctQ08535 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SctQ08535 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SctQ08535 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SctQ08535 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SctQ08535 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SctQ08535 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SctQ08535 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SctQ08535 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SctQ08535 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SctQ08535 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SctQ08535 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SctQ08535 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SctQ08535 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms