Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms