Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms