Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms