Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms