Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms