Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms