Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Thbs3Q05895 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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