Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms