Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 202.5 ms