Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GscQ02591 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GscQ02591 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GscQ02591 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GscQ02591 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GscQ02591 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GscQ02591 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GscQ02591 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GscQ02591 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GscQ02591 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GscQ02591 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GscQ02591 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GscQ02591 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GscQ02591 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GscQ02591 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GscQ02591 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GscQ02591 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GscQ02591 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GscQ02591 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GscQ02591 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GscQ02591 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GscQ02591 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GscQ02591 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GscQ02591 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GscQ02591 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GscQ02591 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GscQ02591 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GscQ02591 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GscQ02591 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GscQ02591 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GscQ02591 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GscQ02591 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GscQ02591 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GscQ02591 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GscQ02591 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GscQ02591 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GscQ02591 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GscQ02591 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GscQ02591 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GscQ02591 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GscQ02591 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GscQ02591 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GscQ02591 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GscQ02591 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GscQ02591 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GscQ02591 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GscQ02591 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GscQ02591 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GscQ02591 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GscQ02591 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GscQ02591 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GscQ02591 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GscQ02591 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GscQ02591 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GscQ02591 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GscQ02591 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GscQ02591 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GscQ02591 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GscQ02591 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GscQ02591 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GscQ02591 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GscQ02591 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GscQ02591 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GscQ02591 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GscQ02591 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GscQ02591 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GscQ02591 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GscQ02591 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GscQ02591 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GscQ02591 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GscQ02591 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GscQ02591 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GscQ02591 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GscQ02591 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GscQ02591 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GscQ02591 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GscQ02591 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GscQ02591 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GscQ02591 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GscQ02591 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GscQ02591 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GscQ02591 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GscQ02591 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GscQ02591 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GscQ02591 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GscQ02591 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GscQ02591 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GscQ02591 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GscQ02591 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GscQ02591 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GscQ02591 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GscQ02591 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GscQ02591 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GscQ02591 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GscQ02591 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GscQ02591 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GscQ02591 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GscQ02591 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GscQ02591 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GscQ02591 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms