Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms