Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms