Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bop1P97452 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bop1P97452 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bop1P97452 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bop1P97452 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Bop1P97452 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bop1P97452 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Bop1P97452 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms