Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nbr1P97432 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Nbr1P97432 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nbr1P97432 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nbr1P97432 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nbr1P97432 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nbr1P97432 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nbr1P97432 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nbr1P97432 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nbr1P97432 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nbr1P97432 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nbr1P97432 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nbr1P97432 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nbr1P97432 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nbr1P97432 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nbr1P97432 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nbr1P97432 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nbr1P97432 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nbr1P97432 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nbr1P97432 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nbr1P97432 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nbr1P97432 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nbr1P97432 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nbr1P97432 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nbr1P97432 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms