Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx3P81067 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx3P81067 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx3P81067 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx3P81067 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx3P81067 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx3P81067 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms