Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeboxP70368 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeboxP70368 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeboxP70368 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeboxP70368 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SeboxP70368 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SeboxP70368 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeboxP70368 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SeboxP70368 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeboxP70368 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeboxP70368 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeboxP70368 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeboxP70368 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeboxP70368 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeboxP70368 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeboxP70368 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeboxP70368 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeboxP70368 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SeboxP70368 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeboxP70368 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SeboxP70368 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeboxP70368 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SeboxP70368 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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SeboxP70368 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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