Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf6P70279 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf6P70279 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf6P70279 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf6P70279 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf6P70279 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf6P70279 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms