Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pkn1P70268 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms