Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tuba4aP68368 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba4aP68368 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms