Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acta1P68134 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acta1P68134 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta1P68134 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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