Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms