Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta2P62737 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta2P62737 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta2P62737 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta2P62737 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms