Protein–RNA interactions for Protein: P62340

Tbpl1, TATA box-binding protein-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbpl1P62340 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms