Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms