Protein–RNA interactions for Protein: P60766

Cdc42, Cell division control protein 42 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42P60766 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42P60766 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42P60766 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42P60766 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42P60766 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42P60766 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42P60766 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42P60766 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42P60766 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42P60766 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42P60766 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42P60766 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42P60766 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42P60766 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42P60766 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42P60766 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42P60766 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42P60766 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42P60766 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42P60766 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42P60766 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42P60766 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42P60766 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42P60766 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42P60766 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42P60766 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42P60766 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42P60766 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42P60766 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42P60766 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42P60766 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42P60766 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms