Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms