Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp5P56399 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp5P56399 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp5P56399 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp5P56399 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp5P56399 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp5P56399 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp5P56399 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp5P56399 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms