Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CdaP56389 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CdaP56389 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CdaP56389 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CdaP56389 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CdaP56389 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CdaP56389 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CdaP56389 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CdaP56389 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CdaP56389 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CdaP56389 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CdaP56389 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CdaP56389 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CdaP56389 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CdaP56389 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CdaP56389 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CdaP56389 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CdaP56389 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CdaP56389 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CdaP56389 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CdaP56389 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CdaP56389 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CdaP56389 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CdaP56389 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CdaP56389 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CdaP56389 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CdaP56389 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CdaP56389 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CdaP56389 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CdaP56389 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CdaP56389 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CdaP56389 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CdaP56389 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CdaP56389 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CdaP56389 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CdaP56389 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CdaP56389 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CdaP56389 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CdaP56389 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CdaP56389 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CdaP56389 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CdaP56389 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CdaP56389 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CdaP56389 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CdaP56389 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CdaP56389 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CdaP56389 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CdaP56389 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CdaP56389 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CdaP56389 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CdaP56389 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CdaP56389 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CdaP56389 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CdaP56389 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CdaP56389 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CdaP56389 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CdaP56389 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CdaP56389 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CdaP56389 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CdaP56389 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CdaP56389 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CdaP56389 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CdaP56389 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CdaP56389 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CdaP56389 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CdaP56389 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CdaP56389 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CdaP56389 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CdaP56389 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CdaP56389 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CdaP56389 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CdaP56389 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CdaP56389 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CdaP56389 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CdaP56389 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CdaP56389 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CdaP56389 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CdaP56389 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CdaP56389 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CdaP56389 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CdaP56389 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CdaP56389 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CdaP56389 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CdaP56389 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CdaP56389 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CdaP56389 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CdaP56389 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CdaP56389 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CdaP56389 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CdaP56389 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CdaP56389 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CdaP56389 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CdaP56389 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CdaP56389 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CdaP56389 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CdaP56389 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CdaP56389 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CdaP56389 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CdaP56389 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CdaP56389 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms