Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms