Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PctpP53808 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PctpP53808 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PctpP53808 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PctpP53808 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PctpP53808 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PctpP53808 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PctpP53808 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PctpP53808 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PctpP53808 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PctpP53808 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PctpP53808 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PctpP53808 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PctpP53808 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PctpP53808 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PctpP53808 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PctpP53808 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PctpP53808 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PctpP53808 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PctpP53808 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PctpP53808 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PctpP53808 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PctpP53808 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PctpP53808 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PctpP53808 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PctpP53808 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PctpP53808 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PctpP53808 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PctpP53808 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PctpP53808 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PctpP53808 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PctpP53808 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PctpP53808 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PctpP53808 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PctpP53808 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PctpP53808 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PctpP53808 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PctpP53808 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PctpP53808 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PctpP53808 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PctpP53808 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PctpP53808 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PctpP53808 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PctpP53808 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PctpP53808 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PctpP53808 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PctpP53808 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PctpP53808 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PctpP53808 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PctpP53808 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PctpP53808 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PctpP53808 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PctpP53808 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PctpP53808 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PctpP53808 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PctpP53808 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PctpP53808 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PctpP53808 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PctpP53808 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PctpP53808 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PctpP53808 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PctpP53808 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PctpP53808 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PctpP53808 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PctpP53808 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PctpP53808 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PctpP53808 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PctpP53808 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PctpP53808 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PctpP53808 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PctpP53808 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PctpP53808 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PctpP53808 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PctpP53808 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PctpP53808 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PctpP53808 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PctpP53808 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PctpP53808 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PctpP53808 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PctpP53808 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PctpP53808 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PctpP53808 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PctpP53808 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PctpP53808 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PctpP53808 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PctpP53808 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PctpP53808 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PctpP53808 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PctpP53808 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PctpP53808 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PctpP53808 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PctpP53808 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PctpP53808 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PctpP53808 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PctpP53808 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PctpP53808 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PctpP53808 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PctpP53808 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PctpP53808 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PctpP53808 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms