Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lbx1P52955 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lbx1P52955 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lbx1P52955 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lbx1P52955 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lbx1P52955 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lbx1P52955 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lbx1P52955 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lbx1P52955 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Lbx1P52955 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Lbx1P52955 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Lbx1P52955 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Lbx1P52955 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Lbx1P52955 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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