Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms